全部商品  / 顯微鏡與影像應用系統整合相關設備  / 顯微鏡-影像控制分析軟體

SVI Huygens Deconvolution 影像處理軟體

顯微鏡影像去卷積 ( Deconvolution )、多維影像視覺化及分析軟體
Huygens 軟體是由荷蘭 Scientific Volume Imaging (SVI) 公司為高端顯微鏡系統而研發的, Huygens 軟體用法簡單,而且結果準確、可靠,使您的顯微鏡影像品質、分辨率、訊噪比提高。 Huygens 軟體有 Huygens Essential 、 Huygens Professional ,而 Huygens Localizer 及 Huygens Core 分別提供更高級的顯微影像的處理及多用戶同時批量去卷積功能。

Macrophage fluorescently stained for tubulin (yellow), actin (red) and the nucleus (DAPI, blue). Left: original image, recorded with a wide field microscope. Right: the same dataset, deconvolved using Huygens Professional. The datasets are visualized with top-view maximum intensity projections.

Data courtesy of Dr. James Evans, Whitehead Institute, MIT Boston MA, USA. (See the EvansMacrophage for more image details).



4Pi two-photon image of F-actin filaments of a mouse skin fibroblast cell. Left: a 'conventional' confocal image. Right: the restored 4Pi two-photon image. Both 3D-images were recorded at the same site of the specimen to allow a direct comparison of both methods. The F-actin fibers are directed along the Y-axis, i.e., perpendicular to the axial image. The 4Pi-confocal restored image reveals more details of the object than the confocal counterpart as a result of the improved 3D-resolution. The actin fiber in the center is substantially better resolved. The axial FWHM resolution in the restored 4Pi image was shown to be 70nm.

Data courtesy of Prof. Stefan W. Hell, Nano Biophotonics group, Max Planck Institute.



 

Huygens 支持的微鏡系系統 Huygens Deconvolution

Huygens 軟件針對顯微系統:

✔ 瑩光顯微鏡系統 Widefield 

✔ 共軛焦顯微鏡系統 Confocal

✔ 多光子共軛焦系統 Multiphoton 

✔ 轉盤共軛焦 Spinning disk 

✔ 超高分辨率顯微鏡 STED 、 3D STED 及

✔ 光層切片瑩光系統 SPIM 、Deconvolution + Fusion

✔ Array detector Confocal, Airyscan, SPAD 25 and more

✔ Rescan confocal system 

✔ Photoactivated Localization Microscopy (PALM), Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM), Ground State Depletion (GSD) 與 DNA PAINT

 

去卷積、圖像校正 Chromatic Aberration CorrectorCross Talk CorrectorObject stabilizer & Stitcher

 

Batch Express

✔ 完全自動的 Batch Express 功能
✔ 替您打開剛採集的圖像,自動對圖像進行去卷積處理與妥善的保存您的結果
✔ 智能的去卷積功能自動對不同圖像作測量與評估,所以結果準確、可靠
✔ 介面容許用戶監察處理進度或正在處理中的圖像
 

Deconvolution Express

✔ 一鍵式快捷而且簡單去卷積功能 , 結果準確可靠 , 用於單圖處理。
✔ 加上預覽結果視窗與顯卡加速,更方便使用。
 

去卷積導航處理 Deconvolution Wizard

✔ 單圖高級處理,尋找最佳去卷積參數設定。
✔ 提供讓用戶微調參數的可能性,例如: 運算次數、信噪比、背景測量、圖像裁剪與過度曝光的像素警告等, 使用不同的計算方法,例如:圖像信噪比異常低而用戶希望使用GMLE 計算。
✔ 用戶有多張圖像,需要使用自動批量處理的情況,先用 Deconvolution Wizard 測試並調整參數設定 。
✔ 產生 Deconvolution Template 去卷積模板,再把模板用於批量處理。
 

自動批量處理圖像 Batch Processor

✔ 批處理程序 (Batch Processor) 允許用戶以自動簡單的方式處理海量數據,根據用戶的需要提供各種計算程序並正確處理數據。
Huygens 軟體採用導航式的便捷操作方法進行去卷積,含有多樣化的去卷積計算模式及影像修復功能,結果準確而且不失真,優化影像的品質。
 

影像修復:

✔ 對於多維的顯微圖像的恢復 (包括多通道和時間序列),Huygens 軟體可以簡單、有效地處理
✔ 矯正球形色差 (Chromatic Aberration)
✔ 對一個瑩光物質在另一通道做成較暗而非真正的訊號 Cross Talk,Huygens 軟體也能作出準確的校正
✔ Object Stabilizer 校正因載物台的位移或樣本因熱而作出的移動,使三維圖像能準確地把樣本展現
✔ 修正多維圖像因為激發光而做成的漂白 (Photobleaching),從而優化圖像
✔ Stitcher 拼圖功能可拼接大量的顯微圖像,並提供去卷積及暗角校正
任何時候您對處理過程中的結果不滿意,可在每個階段中斷顯微圖像的處理過程並調整相關參數,重新啟動處理過程,繼續處理多熒光通道和時間序列的圖像,Huygens 軟體允許您在每個單獨的熒光通道選擇最佳的結果。為了使用戶的電腦更有效地運算而減輕電腦運行功的負荷,Huygens 軟體使用智能修剪工具沿著四面尺度削減和刪除無關的熒光通道。即使您的電腦系統的內存沒有足夠的空間處理一個整體圖像的時候,Huygens 軟體也可將你的數據分解成若干部分,分別處理後再整和在一起。
 

Huygens 支持的文件檔案 File fomats

Huygens 除了能夠直接讀取四大顯微鏡廠商的文件檔(Leica LIF, Zeiss CZI, ZVI, LSM, Olympus OIF, VSI 與 Nikon ND2)外 ,也支持其他的文件檔,詳細內容,請參考 File Formats

Huygens 軟體也具備 
分析功能 ,包括:
✔ 共定位分析 Colocalisation 分析,定量分析不同通道的共定位強度值
✔ Object Tracking 追踪一個或多個物體隨著時間的位移
✔ Object Analyzer 是三維分割、測量 統計分析多維圖像的工具,測量個體在圖像中的互相距離及關係。
 

顯示卡加速去卷積功能 GPU

這個功能是為了龐大的數據、文件而研發的,這個功能利用顯示卡 GPU 多核的特點而進行加速處理。
 

Floating license Floating licesne

Huygens 軟體為了配合顯微鏡平台、實驗室的資源能充分的運用而發展這個功能。附加上這個功能的話,Huygens 軟體無須固定在一台工作站,用戶可隨著實驗室或系上的資源分佈,在研究院、系上的特定 IP 範圍內的電腦裝上 Huygens 軟體,這個 IP 範圍內的電腦均能運作 Huygens ,而多少用戶能同時使用 Huygens 也能由用戶決定,實驗室的資源能得到最有效的使用率。Floating Licesne 中文簡介
 

視覺化功能 Visualization

Huygens 軟體提供的各種各樣的視覺化功能幫助用戶分析影像中細微的部份。
用成對的 Twin Slicer 可將處理結果與原始圖像或者影像中不同的部份進行對比。
MIP renderer 渲染工具是利用圖像中最大亮度的投射,用戶可以隨意在任何角度觀察三維圖像。
SFP 渲染工具可對三維立體圖像進行不同角度旋轉,從而可在任何角度觀測圖像,提供可靠、詳細的三維數據。 表面渲染工具 (Surface renderer) 分析不同數據從而顯示出三維圖像的表面結構。