IMARIS 影像分析軟體

Imaris 目前最新版本 V. 9.6
強化使用的簡單性, 增加影像後續的 ROI 進階分析的新功能-人工智慧深度學習的分類統計. 對 Spot 與 Surface Creation 帶入新的分類程序(Classification Step) , 同時也增加Vantage 1D和新的2D Scatterplot之間的比較分析.

本公司提供專業的受前與售後服務, 提供 Imaris 的教學課程, 現場實習教學與應用指導. 也可為用戶開班授課, 歡迎洽詢 !

Oxford (Andor) 原廠提供10天免費試用版 (上網連結填表申請試用版)
 

 
請閱讀版本發行信息 Imaris 9.6
 
  • ML Classifier used to split Spots into groups based on their local environment and compare created groups on a plot ( )
  • ML Classifier used to split spots into groups based on their density and local environment ( )
  • Nearest neighbour statistics and 1D classification filters in Imaris to split cells into groups based on their density ( )
  • Use Spots and Machine Learning Classification to discriminate background cells in the wound healing time lapse dataset ( )
  • Combine machine learning classification in Imaris with batch processing mode to count cells in a specific region of interest ( )





 
 
Imaris Start Imaris for Tracking Imaris Single Full with ClearView Imaris for Neuroscientists Imaris for Cell Biologists
Imaris Core - Render 3D/4D images, detect objects, snapshot & animation ✓ ✓ ✓ ✓ ✓
Imaris MeasurementPro -Report and interact with detected object measurements ✓ ✓ ✓ ✓ ✓
Imaris Coloc - Visualize and quantify colocalized regions ✓   ✓ ✓ ✓
Imaris Vantage - Plot in 1D-4D, compare groups with statistical tests ✓   ✓ ✓ ✓
Imaris TrackLineage - Track motion in 2D/3D, detect divisions, create lineage tree   ✓ ✓ ✓ ✓
Imaris Filament Tracer - Trace filamentous structures, neurons, vessels, detect spines     ✓ ✓  
Imaris Cell - Segment and analyze cells and their compartments     ✓   ✓
Imaris XT - Customize analysis with Matlab, Python, Java, R     ✓ ✓ ✓
Imaris Batch - Utilise saved protocols for batch analysis     ✓    
ClearView™ - GPU-accelerated deconvolution Optional Optional ✓ Optional Optional
Imaris Stitcher -Precise alignment and stitching of multiple image tiles Optional Optional Optional Optional Optional


Imaris Core
生命科學領域裡最領先的圖像分析軟體 作為 Imaris 軟體家族的核心模組，Imaris是顯微鏡圖像快速交互展示的基本工 具。 . 可直接讀取 30 多種格式的檔，幾乎涵蓋了所有顯微鏡廠家的圖像格式。 . 輕鬆處理 50 GB 甚至更大的 3D/4D 文件 . 提供 Slice, Section, Gallery 等觀察模式，並提供 MIP 投影和混合投影模式。 . 在 Supass 觀察方式下，各種交互工具結合展示（Volume rendering, iso-surface rendering, clipping planes, spots,slices） . 採取易於操作的關鍵幀（key-frame）工具創建內容豐富的電影。 . 通過多種分離工具，自動識別並分離數以千計的物體。 . 通過多個 CPU，GPU，及多解析度渲染模式提高 Imaris 的分析能力，提高渲 染速度。 . Bitplane 的專利觀察模式 InMotion 使 3D 空間中物體的選擇及操作變得非常 容易
 




圖像定量分析的重要工具 通過 Imaris Measurement Pro 模組進行幾何和強度測量，從而 得到定量結果! . 得到點和表面的體積,表面積,橢圓性參數,球化率等結果,並即時展示和輸出. . 精確測量每個 Channel 多個物體的強度值 . 提取或刪除感興趣物體以及相關的定量參數 . 進行基於統計結果的排序和分類 . 在感興趣物體內任意位置添加多個點,可以得到他們之間的距離 . 基於 2D 的感興趣區域可以生成 3D 視圖,並同時得到 3D 測量結果
 



Imaris Coloc
揭秘3D/4D空間位置關係 ImarisColoc模組説明使用者獲得3D/4D空間共定位定量資訊，並 進行空間視圖展示 . 提供多種空間共定位區域的選定方法 . 根據國際標準自動計算共定位閾值 . 即時獲得共定位資料,得到的結果可進行進一步分析 . 空間共定位結果可以展示為新的 Channel,並進行進一步的渲染分析

 


超越視覺展示圖像效果 Imaris Vantage 採用資料與立體視圖結合展示的模式，清晰的 展現隱藏在多維圖像資料中複雜的相互關係 . 實現您預想的多維資料展示模式 . 對 2D-5D 資料進行立體視圖展示 . 最大限度的視圖展示統計結果之間的關聯 . 對軌跡按照一定屬性進行分析和排列 . 在任意視圖中自由添加注釋

 


探索運動的意義, 細胞分子間的運動, 交互關係探索, 偵測細胞的分裂軌跡.
Imaris Track Lineage 是用於 3D/4D 圖像追蹤的前沿科學分析方法 
. 提供多種追蹤演算法優化分析結果 
. 實現數以千計的大規模即時追蹤 
. 方便的手動修改創建軌跡 
. 基於物體的大小,強度,形狀,速度,運動方向,運動曲度等多種參數實現自動追蹤 . 運動軌跡以路徑,運動方向,"Dragon Tails" 等多種方式展示, 排序及分類 與 ImarisXT 模組結合實現更強大的特異性追蹤, 自動跟蹤 3D+時間序列的運動物體

 



對神經結構進行智慧分析和視覺化 Filament Tracer模組對絲狀結構自動檢測，示蹤和結構分析 .使用全自動,手動,AutoPath 以及 AutoDepth 等方法實用有效的神經示蹤. .獲得分支長度,直徑,體積及神經拓撲學等眾多神經專業分析參數 .對手動畫出的分支進行自動中心定位,並與相鄰的區域進行自動連接 .實用的多種分支選擇方法 .使用先進的專業展示功能能夠實現絲狀體和非絲狀結構的同時展示 .FilamentTracer 的資料結果可用於進一步分析 .結合更多模組,實現複雜的絲狀體資料處理

 


揭秘細胞間和細胞內的交流 Imaris Cell模組對每個單獨的細胞進行個體研究，從而分析 多個細胞間或者細胞內的交流狀態。 .揭秘細胞間和細胞內細胞器的關係! .揭秘細胞內細胞器等級的關係! .對有獨立生物學意義的細胞或者器官進行分析 .自動展示和分割細胞膜 .對大量的囊泡狀物體進行自動檢測和分類 .對 3D/4D 圖像進行細胞等級的研究 .對細胞功能,如胞間通訊,進行機制和結構研究 .智慧導航讓您輕而易舉的操作.

 


顯微圖像計算方法的革新 ImarisXT通過與其它經典軟體的交互調用，實現了多功能拓展， 為您的實驗提供更多的計算方法! . 探測前沿科研未知參數的工具，回答您最想要知道的問題 . 在影像處理,分離,分類以及報告等方面增加更多的計算方法. . 新功能與常用介面無縫整合,方便用戶調用 . 流暢的與 Matlab,Java,C++,C#,Visual Basic 以及其他經由 COM 的軟體互相 導入資料 . 模組內置了其他人員開發的常用計算方法 . 實現電腦技術與生物研究的完美整合
 


批量自動執行圖像的分析處理 Imaris Batch 可以自動對2D/3D+時間序列圖像進行批量處理。 . 自動重複多種分析,批量得到圖像結果,為您節省後期分析圖像的時間 . 無需不同模組間的功能交交交互操作,批次處理可以快速得到最終結果 . 在批次處理過程中,根據電腦的使用狀況,智慧進行最有效率的分配 . 在批次處理過程中,平行任務自動分配給不同的處理器以提高效率. . 可以更改參數達到更好的處理效果

 



通過高速電腦運算, 以 Deconvolution 幾何數學運算, 即時圖像澄清處理與演示
 




Imaris Stitcher
可以處理大數據的拼圖.
精準的對準點調整. 拼圖可從 1D 到 3D, 4D.

 
 

The Imaris Learning Center hosts a wide range of tutorial videos, how-to articles and webinars to guide you through the many features of Imaris. We have provided some links below which will get you started on some of our most recent developments.

   
  • ClearView-GPU™ is fast – GPU accelerated ( )
  • ClearView-GPU™  is anchored in the Imaris analysis workflow ( )
  • ClearView-GPU™  is batchable ( )
  • ClearView-GPU™  is automatic - minimal user input required ( )

 

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